La metodología para los Planes Participativos Integrales de Acción en los 5 MUCB del Pacífico Biocultural (Katios-Caoba, Tatamá-Paraguas, Farallones-Calima, Munchique-Saija y Cabo Manglares-Awa) tiene dos niveles. El nivel comunitario incluye 8 pasos para obtener el Consentimiento Libre, Previo e Informado (CLPI) de 58 resguardos indígenas y 71 consejos comunitarios, mediante diálogos, reuniones en lenguas propias y comités de seguimiento. El nivel de MUCB conforma Comités Técnicos Locales (CTMUCB) con PNN, CAR, gobernaciones, municipios, representantes étnicos, INVEMAR, IIAP, FAO y ONUDI. El proceso se fundamenta en el Convenio 169 de la OIT, las políticas de FAO y el manual CLPI, incorpora análisis espaciales y un plan de comunicación con enfoque diferencial (étnico, género, etario). El resultado son 5 planes con acuerdos de voluntades y mecanismos de seguimiento.